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Nous commençons aujourd’hui une série de posts ayant trait à la pénurie d’organes qui ne permet pas de répondre entièrement, loin de là, aux indications de greffe. Le nombre de patients inscrits sur les listes d’attente augmente et ne se résorbe pas. Chaque année, des patients décèdent faute d’une transplantation.

Un article paru en décembre 2018 dans le « Journal of the American Society of Nephrology » tire « le terrible bilan de la pénurie de rein » aux Etats-Unis. Les auteurs estiment à 126 000 le nombre de patients atteints chaque année d’une maladie rénale en phase terminale. Seuls 16% d’entre eux pourront bénéficier d’une greffe. Les 84% autres resteront sous dialyse avec une espérance de vie de moins de 5 ans.

L’article en anglais « The Terrible Toll of the Kidney Shortage » est disponible ici, ou directement sur le site du Jasn.

Par analogie avec les expressions in vivo et in vitro, le terme in silico a été introduit pour qualifier les méthodes numériques qui permettent de simuler ou de modéliser un phénomène biologique à l’aide de l’informatique. Les méthodes in silico sont complémentaires des études in vivo et in vitro. Elles apportent des informations qui sont utiles à la bonne compréhension des mécanismes biologiques.

La robustesse du modèle dépend fortement des données expérimentales sur lesquels il se fonde. Le développement d’un modèle débute par la collecte de données expérimentales fiables. Cette étape est suivie par la caractérisation des structures en vue de les relier à la propriété expérimentale étudiée. Des outils d’analyse de données sont alors employés pour orienter la caractérisation et mettre en place le modèle à proprement dit. Le modèle une fois développé et afin d’estimer son pouvoir prédictif, des données expérimentales supplémentaires sont nécessaires.

Un prochain congrès à Paris, du 26 ou 28 août, réunira des spécialistes de la discipline, notamment des chercheurs qui participent au projet de recherche iLite (voir ici).

L’affiche du congrès est consultable ici.

Save the dates for the VPH2020 Conference organized by Inria and partners in Paris, August 26-28 2020
http://vph-conference.org

Des chercheurs et historiens britanniques ont fabriqué une copie artificielle en 3 dimensions du conduit vocal de Nesyamun, scribe et prêtre du temple de Karnak à Thèbes (l’actuel Luxor) qui vécut sous le règne de Ramsès XI (environ 1099-1060 avant JC).

Ils ont pour cela scanné sa momie, en excellent état et conservée au Leeds City Museum depuis 1823. En combinant l’organe recopié et un larynx artificiel, ils ont permis à Nesyamun de prononcer… une voyelle, un son que personne n’avait entendu depuis 3000 ans. Les dernières volontés de Nesyamun semblent avoir été respectées : les inscriptions sur son sarcophage indiquent qu’il espérait pouvoir de nouveau d’adresser aux dieux comme il l’avait fait durant sa vie.

Cet exemple illustre les résultats qui peuvent être espérés en matière de fonctionnement d’organes par la combinaison de matériau biologique (momifié en l’occurrence) et de technologies de pointe.

L’article, paru dans la revue Nature, est disponible ici :

Synthesis of a Vocal Sound from the 3,000 year old Mummy, Nesyamun ‘True of Voice’

L’ENS Paris-Saclay propose un poste de Maître de Conférence enseignant au sein de son département Electronique Electrotechnique Automatique (EEA) et participant aux activités de recherche en systèmes microfluidiques pour la biologie du Laboratoire Lumière, Matière et Interfaces (LuMIn) dont les tutelles sont l’Université Paris-Saclay, l’ENS Paris-Saclay, le CNRS (INSIS) et Centrale-Supélec.

Merci de prendre connaissance de la description ci-jointe en cliquant ici.

Les chercheurs de l’Université de technologie de Compiègne, de l’Inserm UMR_S1193, du Département Hospitalo-Universitaire Hépatinov, collaborant dans le cadre du projet de Recherche Hospitalo-Universitaire iLite (innovations in Liver tissue engineering), ont montré que des hépatoblastes de la lignée HepaRG, encapsulés dans des billes d’alginate, se différencient et forment de manière spontanée des sphéroïdes d’hépatocytes. La mise en évidence d’une large gamme de fonctions (synthèse, activité enzymatique, détoxification) démontre le potentiel de cette approche pour la mise au point d’un foie bioartificiel externe.

L’article, paru dans la revue Tissue Engineering, est disponible ici :

https://www.liebertpub.com/doi/pdf/10.1089/ten.TEA.2019.0262

Inserm (Institut national de la santé et de la recherche médicale) is looking to hire an experienced scientist to lead stem cell research, develop a team and take part in projects in the field of liver bioengineering.

The place of work is in fully equipped premises within the Paul-Brousse Hospital campus next to the largest European center for liver transplantation (Centre Hépato-Biliaire) in Villejuif, south of Paris.

Please click below to access to the full proposal.

See the job offer

Dans le cadre du projet de Recherche Hospitalo-Universitaire iLite (innovations in Liver tissue engineering), les chercheurs de l’Institut Pasteur, de l’Université Paris-Saclay, de l’Université de Technologie de Compiègne et de ESPCI ont exploré la formation d’organoïdes de cholangiocytes dans des supports naturels et synthétiques sous contrôle de leurs propriétés mécaniques. Ils ont publié leurs résultats dans la livraison de décembre 2019 de la revue « frontiers in Bioengineering and Biotecnology » et montrent les avantages de l’utilisation de supports synthétiques pour les modèles de formation de canaux biliaires.

Dans l’introduction à leur article, les auteurs écrivent : « The integration of bile duct epithelial cells (cholangiocytes) in artificial liver culture systems is important in order to generate more physiologically relevant liver models. Understanding the role of the cellular microenvironment on differentiation, physiology, and organogenesis of cholangiocytes into functional biliary tubes is essential for the development of new liver therapies, notably in the field of cholangiophaties. In this study, we investigated the role of natural or synthetic scaffolds on cholangiocytes cyst growth, lumen formation and polarization. We demonstrated that cholangiocyte cyst formation efficiency can be similar between natural and synthetic matrices provided that the mechanical properties of the hydrogels are matched. When using synthetic matrices, we also tried to understand the impact of elasticity, matrix metalloprotease-mediated degradation and integrin ligand density on cyst morphogenesis. We demonstrated that hydrogel stiffness regulates cyst formation. We found that controlling integrin ligand density was key in the establishment of large polarized cysts of cholangiocytes. The mechanism of lumen formation was found to rely on cell self-organization and proliferation. The formed cholangiocyte organoids showed a good MDR1 (multi drug resistance protein) transport activity. Our study highlights the advantages of fully synthetic scaffold as a tool to develop bile duct models. »

Le texte de l’article est disponible ici :
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fbioe.2019.00417/full

GoLiver Therapeutics, membre de l’Institut Français de BioFabrication, est une start-up née à Nantes en 2017 et pionnière de la thérapie cellulaire du foie en utilisant des cellules souches pluripotentes humaines différenciées.

Dans Les Echos du 5 décembre 2019, GoLiver Therapeutics annonce la signature d’« un protocole d'accord avec l'hôpital Paul-Brousse, à Villejuif, en vue de démarrer les essais cliniques de phase I et II pour le traitement des insuffisances hépatiques sévères .../... Le premier centre français de greffe du foie (par ailleurs siège de l’Institut Français de BioFabrication, ndlr) s'allie à la start-up nantaise, issue de l'Inserm et de l'université de Nantes, car elle développe une solution alternative dans un contexte de pénurie de donneurs, avec trois greffons disponibles pour dix demandes .../... La valeur ajoutée de la start-up de biotechnologies réside dans la capacité à sélectionner les cellules souches, embryonnaires ou iPS les mieux adaptées mais, aussi, au choix des ingrédients nutritifs, physiologiques et chimiques nécessaires à la conversion des cellules pluripotentes en hépatocytes congelés injectables. Ce biomédicament a fait ses preuves en préclinique sur des souris, sauvées d'une insuffisance hépatique aiguë .../... Avec les experts en transplantation de cet hôpital, nous allons pouvoir définir le design et la mise en place des essais cliniques, que nous comptons commencer d'ici à quatre ans, précise Tuan Huy Nguyen, président de GoLiver. »

Par ailleurs, dans Le Monde du 19 décembre 2019, GoLiver Therapeutics est le symbole de la réussite des acteurs nantais (Université, Inserm, CNRS, CHU) à faire éclore des entreprises issues de leurs laboratoires. « Son créateur, Tuan Huy Nguyen, affiche l’ambition de devenir un leader mondial dans la médecine régénérative en mettant sur le marché, à l’horizon 2025, un traitement innovant des maladies du foie évitant de recourir à une greffe .../... et susceptible de guérir les insuffisances hépatiques aiguës, les maladies génétiques, les cancers du foie ou même les cirrhoses .../... Chez la souris, il ne s’agissait que d’injecter 1 million de cellules. Pour l’homme, il faut passer à 2 milliards, détaille M. Nguyen. Très vite, en tant que chercheur, on se heurte à la barrière de l’industrialisation de la production, qui nécessite un niveau de financement très élevé, en l’occurrence 15 millions d’euros. D’où la nécessité de créer la start-up pour réussir à transformer cette innovation en un médicament. »

Article Le Monde :
https://www.lemonde.fr/campus/article/2019/12/14/dans-les-biotechnologies-et-la-sante-le-jeu-a-la-nantaise-fait-eclore-des-pepites_6022843_4401467.html

Article Les Echos :
https://www.lesechos.fr/pme-regions/innovateurs/goliver-therapeutics-developpe-une-alternative-a-la-greffe-du-foie-1153851

L’UMR-S 1174, membre du projet iLite (innovations in Liver tissue engineering), cherche à créer un réseau de canalicules biliaires fonctionnel.

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l'Institut Français de BioFabrication, en collaboration avec l’Université Paris-Sud et le Département Hospitalo-Universitaire Hépatinov, met à disposition des étudiants, des chercheurs et de toute personne intéressée son MOOC « Tissue & Organ Bioengineering » sur la plateforme FUN. Ce cours en ligne est le tout premier qui traite de la fabrication de tissus et d’organes, un vaste domaine scientifique dont l’exploration commence.

Vous pouvez télécharger la présentation du MOOC ici:

Présentation-MOOC-Tissue-Organ-Bioengineering.pdf

Vous pouvez accéder directement au MOOC sur la plateforme FUN en cliquant ci-dessous:

https://www.fun-mooc.fr/courses/course-v1:pasteur+96007+session01/about

La jeune société Cyprio, créée en 2017 et spécialisée dans la production de sphéroïdes de cellules hépatiques et pancréatiques, recrute!

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French companies and clinical researchers create a center of gravity for liver bioprinting.

On Wednesday, September 13th, Biopredic International and Cellenion unveiled a new joint “IFBF-Institute” laboratory at Hospital Paul-Brousse in Villejuif (south of Paris).

Cellenion, a daughter company of Berlin based Scienion AG, is a specialist in fully automated printing of viable cells for applications in the fields of bio-printing and bio-analytics. Biopredic International, a company based in Rennes, is a world leader in the production of a large range of cells and associated products for industrial research applications, with focus in pharmacokinetics, toxicology and pharmacology studies.

“Being able to work using bioprinting technologies offering resolution down to single cell is a fundamental tool in biology, tissue engineering and regenerative medicine” said Guilhem Tourniaire, Directeur Général at Cellenion, “With Biopredic, we have found a partner with excellent cell-based products and deep expertise in liver tissues engineering. This new facility will enable close collaborations with world-class clinicians and researchers to drastically accelerate development in liver tissue bioengineering”.

« We are a very customer focused company. As such, we always seek to expand our portfolio of solutions across the latest platform technologies” states Christophe Chesné, Chief Executive Officer at Biopredic and adds “Cellenion’s new acoustic based bioprinting technology is very synergistic with our cell and cell culture capabilities. The expertise of both companies are highly complementary, and working together in a joint laboratory will extend the companies’ clinical reach far beyond what was possible today”.

In recognition to the instrumental role of the association IFBF-Institute in enabling this joint laboratory opening, the laboratory was officially named “IFBF-Institute”. This Paris-based association funded by donations is dedicated to build an international platform devoted to the construction of bioengineered tissues in order to address the shortage of organ suitable for transplantation.

“IFBF-Institute is very pleased that two high tech and key commercial partners for regenerative liver sciences have settled in Villejuif and started joint activities in close proximity to patient care at Paul-Brousse Hospital“ states Prof. Dominique Franco, Founder and Chairman of IFBF-Institute.

Cellenion, Biopredic, IFBF-Institute and scientists at Paul-Brousse Hospital Campus are also members of the iLite (Innovations Liver Tissue Engineering) RHU project. iLite is a 5-year project funded by the National Research Agency (ANR), directed by professor Jean-Charles Duclos-Vallée, that gathers leading French researchers, clinicians and industrial partners to develop an external bio-artificial liver for acute liver failure patients, liver-on-a-chip platform for toxicology studies and, in the longer term, a transplantable bio-constructed liver. The joint laboratories of Cellenion and Biopredic are geared to accelerate research within the iLite consortium and establish new collaborations with researchers and clinicians at Paul-Brousse Hospital as well as other university hospitals in the region.

Cécile Legallais, Directeur de Recherche CNRS à Université de Technologie de Compiègne, détaille ses recherches sur un dispositif de foie bio-artificiel externe. Mme Legallais et son équipe participent au projet de RHU (Recherche Hospitalo-Universitaire en santé) iLite en compagnie d’autres membres de l'Institut Français de BioFabrication.

Écouter l’interview de CNRS-la radio (0-11mn et 35-38mn)

Le Commissariat à l’Energie Atomique (CEA), l’un des partenaires du projet iLiTE (innovation for Liver Tissue Engineering), recrute un chercheur post-doctorat en techniques de microstructuration et de bioimpression.

Le DHU Hépatinov est la structure coordinatrice du projet iLiTE de Recherche Hospitalo-Universitaire en santé (RHU). Il vient de lui être attribué un financement de 8,5 M€ pour son projet d’innovation pour l’ingénierie tissulaire du foie (innovation for Liver Tissue Engineering). 

L’association IFBF, créée à l’initiative d’Hépatinov, a pour objet la construction d’organes par bio-ingénierie, et représente donc Hépatinov dans l’exécution du projet iLite. A ce titre, l'IFBF recrute des chercheurs doctorants et post-doctorat pour les différents work-packages inclus dans ce projet, à savoir :

* Imaging, image analysis, in silico models, and software generation (WP1)

* Liver tissue/organoids (WP2)

* Construction of biliary duct network (WP3)

 * In vitro construction of a vascular network (WP4)

* Integration of liver organoids into vascular and/or biliary networks and scale-up (WP5)

* Liver-on-chip (WP6)

* External bio-artificial liver (WP7)

* Safety/GMP/Industrialization (WP8)

Le lieu de travail sera essentiellement dans la région parisienne mais quelques postes sont également à pourvoir en province. Les premiers recrutements sont prévus pour début octobre 2016. Pour faire acte de candidature, écrire par courriel à :

* Professeur Jean-Charles Duclos-Vallée, Coordinateur d’Hépatinov, jean-charles.duclos-vallee@idfb-institute.org

* Professeur Dominique Franco, Président de l'IFBF, dominique.franco@idfb-institute.org

Le jury international du deuxième appel à projets RHU (Recherche Hospitalo-Universitaire en santé) du Programme d’Investissements d’Avenir a décidé de financer 10 projets dont iLiTE (innovations in Liver Tissue Engineering)

Le programme RHU soutient des projets de recherche translationnelle associant secteurs académique, hospitalier et entreprises. Les 10 projets financés vont permettre de renforcer les liens entre la recherche fondamentale et ses applications cliniques mais également industrielles, et s’inscrivent tant dans la stratégie nationale de recherche que dans la stratégie nationale de santé voulues par le Gouvernement.

iLiTE (innovations in Liver Tissue Engineering) dont le pilote est  DHU Hepatinov rassemble des équipes des hôpitaux Paul-Brousse et Saint-Louis (AP-HP), de l’Université de Paris Saclay, du CEA, de l’INSERM, de l’INRIA ainsi que quatre entreprises. Tous ces acteurs sont membres de l'Institut Français de BioFabrication qui a fédéré leurs énergies et ambitions. Ce succès affirme  la stratégie de l'Institut Français de BioFabrication de réunir toutes les compétences en médecine, biologie, sciences physiques et ingénierie pour favoriser la création d’organes par bio-ingénierie.   

Voir le communiqué de presse

Dans le cadre de la semaine de l’industrie (http://www.entreprises.gouv.fr/semaine-industrie) qui se tient du 16 au 20 mars 2016, une conférence est donnée par Dominique Franco, Président de l'Institut Français de BioFabrication, sur la fabrication d’organes par bio-ingénierie, le samedi 19 mars 2016, de 15h à 17h, dans les locaux de l’école Sup’Biotech, 66 rue Guy Moquet à Villejuif.

En raison des événements récents, une réunion de l’International Council of Monuments and Sites (ICOMOS) a été organisée à Paris le 4 mars 2016. Etaient présentes 65 personnes représentant les 5 continents. La reconstruction après les destructions récentes dues à des événements naturels comme le tremblement de terre au Népal ou au terrorisme comme les destructions en Syrie et dans le nord du Mali ont été évoquées en abordant les problèmes de conservation du patrimoine, du financement, du moment de la reconstruction dans un monde où les frontières temporelles de la guerre sont floues, et de la participation de la population locale à la reconstruction. Il a été souligné que parfois la reconstruction d’un lieu hautement social pouvait prendre le pas sur celle de l’habitat. Les nombreux problèmes éthiques posés par cette reconstruction ont été évoqués. l'Institut Français de BioFabrication a été convié à cette réunion pour exposer les techniques de reconstruction de l’homme, les règles et les aspects éthiques. Cela a été l’occasion d’évoquer les problèmes posés par la construction d’organes par bio-ingénierie, les nouvelles technologies et l’ingénierie génétique permettant d’améliorer les performances de l’homme et d’aborder le trans-humanisme.  Les avancées technologiques et la nécessité d’adaptation sont des facteurs du formidable développement de la reconstruction de l’homme dans un sens très général.

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Ces RHU sont réservés aux équipes ayant obtenu un Département Hospitalo-Universitaire (DHU) et vise à combler le très maigre financement qui caractérisait ces DHU. Un premier tour de cet appel d’offre a sélectionné 4 projets avec des thématiques très variées. Le DHU Hepatinov dont est issu l'Institut Français de BioFabrication avait soumis un projet sur la bio-construction qui a été classé 5ème, et 1er non retenu. Dans son analyse, le jury international avait souligné l’excellence du projet scientifique mais avait suggéré qu’il soit recentré exclusivement sur la bio-construction du foie. C’est chose faite. Le nouveau projet a été mis en ligne le 10 février dernier. Vous en trouverez ci-joint le résumé.

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